L’emplacement actuel de notre village est un terrain conquis aux cours des siècles sur l’Ill et le Rhin, qui à l’origine y mêlaient au sein d’une vaste forêt paludéenne leurs eaux en une infinité de bras se regroupant capricieusement et baignant les bords de tout un archipel d’îlots plus marécageux que fermes et dont certains ne duraient que l’espace de deux crues. C’est dans ce site, paradis peut-être pour les grenouilles et les moustiques, mais habitat malsain pour lui, que l’homme par un lent et patient travail : consolidation des berges, correction de bras d’eau, conquit ces prés et ces champs, créa ainsi notre village.
L'origine d'Illkirch, comme son nom même l'indique semble due à une église (Kirche) construite sur les bords de l'Ill. La date de construction de cette première église nous est inconnue et difficile à établir, mais d'après la tradition locale qui désigne l'église protestante d'Illkirch sous le nom de "Heidetempel" (temple païen) ainsi qu'une vieille chronique "Ein alter Ort, um eine noch ältere Vorortskirche herum, aus den frühesten Zeiten der Völkerwanderung", nous pouvons dire que son antiquité est respectable et doit remonter au temps des Francs.
Jusqu'à nos jours de nombreuses fouilles ont permis de découvrir des molaires et des défenses de mammouths (Île des Pêcheurs) qui datent de l'époque quaternaire, un marteau perforé en serpentine Suisse trouvé au Baggersee, un poids lacustre à la gravière Gehrig (Ostwald), une hache de bronze, des pilotis (près de l' Île des Pêcheurs), des urnes funéraires romaines et les fondations d'une villa romaine avec "hypocaustum" (Ostwinkel) ainsi que divers objets aux lieux-dits Schwammenegerthal, Schaffhardt, Hobrück (pont du Canal), Grosshirchbühl, Junkerngut.